借鉴发达国家食品安全管理经验，结合我国和北京市实际情况，从长远考虑，我国食品安全监管体制应由综合协调多部门分段监管向综合协调多部门品种监管转变。在国家现有体制下，北京要进一步完善以市场监管部门牵头多部门分段监管模式，以市场准入制为核心，以综合协调为依托，以社会信用体系建设为保障，通过综合运用法律、行政、经济和技术手段，进一步强化源头管理，风险管理，全程监管，从而全面提高食品安全控制能力和监管能力，构建与中国特色世界城市相适应的食品安全监管体系。
1、以法律的完善保障食品安全的市场准入。食品安全的市场准入是包括主体准入和客体(商品或服务)准入。即通过在进入市场环节实施市场准入，在市场交易环节实施动态监管，对不合格食品或违法经营者实施市场退出的机制，对食品安全实施从农场到餐桌的全程监管。目前，北京的一些食品市场准入管理，需要修改完善《北京市食品安全条例》加以保证。具体来说：一是加强市场准入管理，明确食品批发市场开办条件、开办者责任义务;明确重大活动食品安全保障要求，重大活动主办单位、食品生产经营单位、监管部门法律责任;加强专门从事食品仓储、物流、运输等经营活动的监管等。二是要强化地方政府的监管职责。进一步明确乡镇街道食品安全职责，以利于承担其区域内对小作坊、食品摊贩、非法食品生产、加工、储存和销售等行为的监管。三是要明确相关部门职责。就食品现场制售，包装、储运等食品相关行为，送餐企业、餐饮器具集中消毒企业、民俗旅游户、庙会餐饮服务提供者等特殊经营主体，细化和明确监管部门及职责，解决监管空白与职责交叉问题，实现食品安全全程和无缝隙监管。
2、建立完善协调有力的综合协调平台。在市食品安全委员会统一领导的框架下，建立协调有力的综合协调和决策的指挥平台，实现监管部门之间的互联互通。比如对食品安全应急事件的处置问题上，需要明确统一指挥调度程序，区县政府、市食品安全委员会和食品办、市应急办的职责，谁牵头，谁调度应重新加以明确，避免处置现场的混乱。进一步完善日常监督协调。完善市场准入、统一监测、突发事件应急处理、食品安全信息统一归集与发布等工作机制。建立全面的食品安全督导检查机制，督促各食品安全监管部门、各区县政府及各街、乡、镇落实各项食品安全管理制度。
3、切实发挥风险管理在食品安全科学监管的作用。食品污染涉及多因素、多环节、多主体，要逐步实现从最终产品监管到全过程的预防性监管。科学引导舆论，增强食品安全公共事件媒体应对能力，营造良好食品安全消费环境。提高居民食品安全知识素养。
4、提高监测能力，建立科学监测体系。一是开展食品安全科学的基础性研究、高技术研究、关键技术前瞻性研究和相关战略研究。二是紧跟国际先进水平，围绕我市食品安全监管重点及难点，重点开展涉及非食用物质、食品添加剂、食品接触材料、持久性有机污染物、辐照食品的分析测试、风险评估等技术研究。如当前发生的有餐饮企业使用“一滴香”问题，在大量实验数据的基础上，通过专家分析评估证明是安全的。
5、强化信用体系建设，加强信用监管。加强信息披露制度建设，对不合格食品及其生产者实行公开预警、警告、通告，达到守信奖励和失信惩戒的目的。对食品生产经营者实行严格的信用管理制度，凡在食品生产、销售方面有过严重劣迹的，终身不得从事食品行业。推行信用评价措施并以此作为食品安全管理中监管依据。通过建立统一的企业和食品信用信息平台，归集信用信息记录，对食品和企业实施信用监管。总之，良好的社会信用体系是食品安全有效监管的保障。
