一、收入预算
(一)财政拨款收入:指中央财政当年拨付的资金，2011年年初预算数为2,371,725.88万元，比2010年年初预算数增加378,098.9万元，增长18.97%,主要是国家科技计划(专项)等经费预算增加。
(二)事业收入：指事业单位开展专业业务活动及辅助活动所取得的收入，2011年年初预算数为34,730.51万元，比2010年年初预算数增加287.48万元，增长0.83%。
(三)事业单位经营收入：指事业单位在专业业务活动及其辅助活动之外开展非独立核算经营活动取得的收入，2011年年初预算数为2,339万元，比2010年年初预算数减少261万元，降低10.04%。
(四)其他收入：指除上述财政拨款收入、事业收入、事业单位经营收入以外的收入，2011年年初预算数为4,292.07万元，比2010年年初预算数增加334.04万元，增长8.44%。
二、支出预算
(一)外交支出，主要用于驻外机构、对外援助、国际组织会费、国际组织捐赠等方面，2011年年初预算数为9,150.6万元，比2010年年初预算数增加3,023.37万元，增长49.34%。主要是科技合作援外支出增加。
(二)科学技术支出，主要用于国家科技计划(专项)等经费支出，2011年年初预算数为2,410,974.58万元，比2010年年初预算数增加297,618.95万元，增长14.08%。主要是基础研究、应用研究、技术研究与开发等项目支出增加。
(三)社会保障和就业支出，主要用于机关离退休人员及离退休人员管理机构等支出，2011年年初预算数为2,115.9万元，比2010年年初预算数增加268.33万元，增长14.52%，主要是规范津贴补贴支出增加。
(四)资源勘探电力信息等事务支出，主要是用于支持科技型中小企业发展和管理支出，2011年年初预算数为27,335万元，比2010年年初预算数增加27,335万元。主要是因为科技型中小企业创业投资引导基金阶段参股项目支出经费纳入科技部部门预算。
(五)住房保障支出2,968.03万元，比2010年年初预算数减少173.97万元，降低5.54%。
一、2011年，科技部财政拨款支出年初预算数为2,371,725.88万元，比2010年执行数减少24,938.45万元，降低1.04%。其中：
(一)外交支出2011年年初预算数为9,150.6万元，比2010年执行数增加3,056.37万元，增长50.15%。
1.驻外机构2011年年初预算数为917万元，比2010年执行数增加34.75万元，增长3.94%。
2.对外援助2011年年初预算数为7,200万元，比2010年执行数增加3,000万元，增长71.43%。主要是科技合作援外项目支出增加。
3.国际组织2011年年初预算数为973.6万元，比2010年执行数增加126.62万元，增长14.95%。主要是国际组织会费和国际组织捐赠支出增加。
4.对外合作与交流2011年年初预算数为60万元，比2010年执行数增加60万元。主要是新增了碳收集领导人论坛第四届部长级会议项目支出。
5.其他外交支出2011年年初预算数比2010年执行数减少165万元。主要是有关一次性项目支出减少。
(二)科学技术支出2011年年初预算数为2,331,284.38万元，比2010年执行数增加83,245.59万元，增长3.7%。
1.科学技术管理事务，主要用于行政运行、机关服务等，2011年年初预算数为9,186.18万元，比2010年执行数减少1,949.93万元，降低17.51%。主要是有关一次性项目支出减少。
2.基础研究，主要用于国家重点基础研究发展计划(973计划)、国家(重点)实验室引导经费等，2011年年初预算数为370,000万元，比2010年执行数减少50,000万元，降低11.9%。主要是2010年预算执行中追加安排了973计划项目支出，2011年年初有关项目支出减少。
3.应用研究，主要用于国家高技术研究发展计划(863计划)等，2011年年初预算数为878,036.53万元，比2010年执行数增加112,451.29万元，增长14.69%。主要是863计划项目支出增加。
4.技术研究与开发，主要用于国家科技支撑计划、政策引导类计划等，2011年年初预算数为601,800万元，比2010年执行数增加67,160万元，增长12.56%。主要是政策引导类计划项目支出纳入科技部部门预算。
5.科技条件与服务，主要用于科技文献信息专项、科技基础性工作专项等，2011年年初预算数为47,300万元，比2010年执行数增加5,200万元，增长12.35%。主要是有关项目支出增加。
6.科学技术普及，主要用于科技活动周专项，2011年年初预算数为1,000万元，与2010年执行数相同。
7.科技交流与合作，主要用于国际科技合作与交流专项、国际热核聚变实验堆(ITER)计划专项等，2011年年初预算数为174,528万元，比2010年执行数减少57,357万元，降低24.74%。主要是2010年预算执行中追加安排了国际科技合作与交流专项项目支出，2011年年初有关项目支出减少。
8.科技重大专项，主要用于相关科技重大专项管理工作， 2011年年初预算数为150万元，比2010年执行数减少200万元，降低57.14%。主要是在年初预算中安排的科技重大专项管理费减少。
9.其他科学技术支出，主要用于解决转制科研机构转制前离退休人员的社会保障问题、国家科技奖励专项经费支出等，2011年年初预算数为249,283.67万元，比2010年执行数增加7,941.23万元，增长3.29%。主要是转制科研机构规范津贴补贴支出增加。
(三)农林水事务支出2011年年初预算数比2010年执行数减少8,600万元。主要是2010年预算执行中追加安排了农业科技成果转化支出，2011年年初未安排相关支出。
(四)社会保障和就业支出2011年年初预算数为1,645.9万元，比2010年执行数增加149.34万元，增长9.98%。主要是规范津贴补贴支出增加。
(五)资源勘探电力信息等事务支出2011年年初预算数为27,335万元，比2010年执行数减少9,947.75万元，降低26.68%。主要是科技型中小企业创业投资引导基金阶段参股项目支出减少。
(六)住房保障支出2011年年初预算数为2,310万元，比2010年执行数减少92,842万元，降低97.57%。主要是转制科研机构转制前离退休职工购房补贴一次性支出减少。
二、2011年，核定科技部用财政拨款支出安排的出国(境)费、车辆购置及运行费、公务接待费三项经费预算4,018.72万元。
