目前基层食品快速检测工作中存在的问题，是快速检测设备功能自身的局限性。
一是食品快速检测箱检测范围过窄，现行食品快速检测箱的设施功能基本上只限于对蔬菜的农药残留以及部分食品中的二氧化硫等的快速检测，不能对流通环节的诸多食品种类进行全覆盖检测。
二是配套设施不全，工具简陋，检测准确性不高。
三是快速检测的法律效力不强。运用快速监测的食品不符合国家标准时，还要再进行抽样送检定性。然后是检测经费严重不足。基层工商分局没有专门用于食品检测的费用预算开支，诸多地方政府也没有给工商部门依法核拨食品安全监管经费，致使基层分局(所)食品快速检测工作成了无米之炊。
四是检测队伍水平不高。现有检测人员中只是经过市局的短暂培训，食品检测人员的专业知识仍显欠缺，对食品须测与否判定不准。
为了切实做好食品快速检测工作，针对以上问题我们提出了下面几点对策和建议：
一、从严规范食品安全快速检测工作。必须严格按照相关的法律法规和上级要求，制定符合实际、严密规范的检测程序，并严格按照抽样的操作程序规范运作。完善快速检测仪器的配置。在品种上选择消费者投诉较多、媒体曝光频率高、流通环节流量较大并与人民群众密切相关的重点食品。
二、营造食品快速检测的社会氛围。强化相关部门职能在多层次、多角度、多方面对食品安全的协同作战，齐抓共管。
三、提升食品快速检测效果。充分发挥已配备的食品快速检测箱、检测室和检测车的作用，对涉嫌问题食品先进行预检，预检不合格后再送到法定检验机构。
四、建立健全上下联动的食品快速检测机制。建立以基层工商分局(所)为主，农贸市场、超市为辅，以基层分局为抓面、管辖农贸市场及超市为抓点的快速检测机制，形成上下级之间、部门之间有机协调统一，避免重复检测造成的行政资源和检测成本的浪费。
