光照培养箱的使用，为避免细菌对实验结果造成影响，消毒也是不可少的步骤之一。
首先要对实验器材的消毒。
光照培养箱消毒，先用酒精擦拭内壁，通风10分钟，紫外线照射30分钟即可。
如果没有紫外线照射，一般用70%的乙醇擦洗,然后再用0.1%的新洁尔灭擦洗，可再用高锰酸钾加醛1:1比例熏一遍，注意要是熏的话千万注意混合之后马 上离开，然后密闭细胞培养室,因为味道具有刺激性，最好在养细胞前消毒，培养箱的底层是不可以放东西的，会影响均匀度，不利于细胞生长的环境。
使用消毒剂应小心，培养箱内有检测温度、温度和二氧化碳浓度的传感器，腐蚀性消毒剂或有机溶剂有可能损坏
不同的培养箱有不同的清洁方式，应仔细阅读产品的具体操作手册或者咨询培养箱技术支持，某些器件，请慎用。还有挥发性的甲醛有毒，易燃、易爆，如果在培养箱内残留甲醛的话是一定要注意的，会影响细胞的生长。
