海洋国家实验室学术委员会是在实验室理事会管理下的学术咨询和指导组织，负责向理事会提供有关创新研究方向、重点发展领域、重大研究任务和目标等学术问题的咨询意见和建议，指导和把握科研方向，并进行学术评估工作。海洋国家实验室第一届学术委员会主任由中国工程院院士管华诗担任，中国科学院院士胡敦欣、中国工程院院士袁业立和侯保荣，以及美国伍兹霍尔研究所研究员林间等15位国内外海洋科学家共同组成本届学术委员会。
第一届学术委员会的成立，标志着海洋国家实验室进入全面发展新阶段。学术委员会成立后，将充分集纳海内外专家意见建议，为实验室提出符合国家战略的重大科研项目，为建设海洋强国提供科技支撑。
根据规划，未来3年-5年，海洋国家实验室将在西太平洋、印度洋和南中国海实施海洋环境与气候，深远海渔业资源与海洋药物资源开发，海底油气、矿产资源开发与环境研究三大战略，通过布放潜标等方式，致力于海洋观测、海洋环境过程机理研究与海洋环境预测的结合，开展“透明海洋”研究，保障21世纪海上丝绸之路建设。为实施这三大战略，海洋国家实验室将从三方面着手推进：一是启动“鳌山人才”培养计划，为卓越科学家、优秀青年学者和优秀工程师提供专项经费支持;二是开展海洋工程装备研发与国际科考船队建设;三是构建全球海洋科技合作交流网络。
