实验室筹建过程中，秦皇岛海关技术中心与西北农林科技大学、华南农业大学、宁夏大学、云南香格里拉酒业有限公司、中粮华夏长城葡萄酒业有限公司等国内知名院校、生产企业签订战略合作协议，与上海海关动植物与食品检验检疫技术中心、宁波海关技术中心、广东省食品质量安全重点实验室、甘肃省葡萄与葡萄酒工程学重点实验室等建立合作关系，进一步增强科研创新能力，促进葡萄酒质量安全“产学研检”全方位协同创新。
目前，秦皇岛海关技术中心已成为国内唯一一家同时建有“国家葡萄酒检测重点实验室（秦皇岛）”“进出口酒类应急检验检测实验室”“国家级进出口食品质量安全风险验证评价实验室（酒类）”“河北省葡萄酒质量安全检测重点实验室”“秦皇岛市葡萄酒检测重点实验室”等5个酒类专业实验室的机构。
