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深蓝云naica两种浓度微滴芯片数字PCR预混液新品上市

   2021-05-12 197
核心提示:  数字PCR是一种精准的核酸绝对定量技术,可对目标基因进行绝对定量,具有卓越的灵敏度和精准度。其灵敏度高的关键因素在于将P
   数字PCR是一种精准的核酸绝对定量技术,可对目标基因进行绝对定量,具有卓越的灵敏度和精准度。其灵敏度高的关键因素在于将PCR混合液分割成数万个油包水的独立微滴。液相和油相之间的界面上发生的化学相互作用可能会影响PCR扩增效率。PCR预混液的组成和性能对于确保靶点的有效扩增和微滴稳定性至关重要。naica® multiplex PCR MIX是数字PCR头部企业法国Stilla Technologies公司生产,专用于在naica® 微滴芯片数字PCR系统,在整个检测动态范围内,提供强大的微滴稳定性和卓越线性范围的多重目标基因的定量检测。

 

为了达到最佳灵活性和灵敏度,我们提供5X和10X浓度的naica® multiplex PCR MIX以降低MIX用量,从而使得更多的反应体积可供更多的模板、引物或探针的加入。
 


 

naica® multiplex PCR MIX可在naica®微滴芯片数字PCR系统的动态范围内对多个靶点进行同时定量,并保持良好线性。

采用0.2到13000cp/uL的DNA样本,使用10X naica® multiplex PCR MIX,在naica®微滴芯片数字PCR系统上进行三个靶点的同时检测(图1)。高浓度的PCR MIX(5倍和10倍浓度均可使用)可使样本输入体积最大化,从而提高低浓度样本中目标靶点的检测能力。

▲ 图1:使用naica® multiplex PCR MIX同时对3个靶点(BRAF、ALB和pUC18)进行线性定量。将人类基因组(hg)DNA和pUC18质粒进行连续稀释(0.2、1.5、8.0、50、320、2050和13000cp/uL),各稀释液进行3次重复检测。结果显示各靶点的线性关系好,R2均大于0.99,说明结果高度真实可靠。

 

在多重检测中可以对低浓度靶点进行稳定且灵敏的检测。

多重检测中多个靶点的共扩增比单个靶点的扩增更为复杂,可能会因为潜在的干扰和反应复杂性的影响,导致多重检测的线性范围降低。在naica®微滴芯片数字PCR系统上使用naica® multiplex PCR MIX分别进行3重和单重检测(图2),结果发现,不管是在高浓度的外部靶点(BRAF和ALB hgDNA)存在的情况下(图2A)还是在外部靶点不存在的情况下(图2B),两组实验中pUC18线性量化的动态范围一致,且阳性微滴和阴性微滴群组的荧光水平和可分性也高度一致。此外,不管是单重还是3重检测,pUC18靶点都能得到可靠的定量(图3),且检测范围和线性度一致。


▲ 图2:使用naica® multiplex PCR MIX进行的3重和单重扩增的比较。将pUC18质粒的13000至0.2 cp/uL的系列稀释液在2个外部扩增靶点背景下(每个靶标为3000cp/uL,图A))和在不含外部靶点(图B)的情况下进行定量检测,3次重复。结果显示,3重和单重扩增中pUC18的检测结果高度一致。注:3重和单重的反应液中均含有pUC18、BRAF和ALB的特异性引物探针。


▲图3:使用naica® multiplex PCR MIX的扩增结果真实可靠。采用13000-0.2cp / uL的pUC18 DNA稀释液进行3重(A)和单重检测(B),各稀释液进行3次重复。(A) 3重反应中额外加入3000cp / uL(10ng)的hgDNA模板;(B) 单重反应中没有额外加入hgDNA模板。结果显示,3重和单重反应中,pUC18均能获得真实可靠的定量结果,同时检测范围和线性高度一致;3重反应中BRAF和ALB检测也具有良好的重复性,相对标准偏差在2.3-2.5%之间,n=21。

 
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