据了解，崖州湾种子实验室着力创建崖州湾国家实验室，打造国家战略科技力量。在人才团队上坚持“不求所有、只求所用”，探索新型研发机构的科研模式。在制度建设上，该实验室采取理事会领导下的主任负责制，按照科研规律进行大胆探索。目前，该实验室汇聚了全国15家生物育种领域高校、科研机构和企业作为成员单位。经省政府同意，出台了《关于优化海南省崖州湾种子实验室管理的若干意见》，赋予实验室财政资金使用、用人、科研项目管理、科技成果转化自主权。
在创新招才引才机制上，该实验室推行报备员额制管理办法，探索“双聘”机制落地。目前，该实验室已引进18个院士团队。同时设立“项目博士后”制度，给予专项资金资助，吸引了75名博士后到岗开展工作，集聚大量优秀青年科研人员开展基础前沿研究和关键技术攻关。
在创新项目组织模式和管理机制上，该实验室聚焦国家种业发展战略和先进生物育种技术，实施重点项目“揭榜挂帅”制，面向全球公开发布科研需求榜单，吸引40余家科研单位应征揭榜，开展76个科研项目攻关，聚合376名全国科研人员来海南开展科研活动。建立起实验室与企业联合攻关机制，研究解决种子产业链“卡脖子”技术难题和企业自身力量无法攻克的关键核心技术难题，由企业提出需求和榜单，实验室和企业共同出资，通过“揭榜挂帅”方式吸引国内最优秀的科研力量来实验室开展攻关。
在搭建大型仪器和设施的共享平台上，建立实验室大型仪器和设施共享平台，按照“统管共用、专人负责、预约登记、收费使用”方式进行管理，面向所有理事单位科研人员和实验室科研攻关团队开放，发挥博士后和青年科研人员专业知识，参与仪器管理。
