新建实验室总面积约1500平方米，由7个分室组成：一楼为土遗址建造工艺实验室、土遗址修复实验室，二楼为模型模拟实验室，三楼为生物实验室、化学实验室、检测分析实验室和综合实验室，同时包括标本室、会议室、专家研究室等多个配套空间。实验室具有先进的研究条件和研究环境，大型仪器设备主要有傅里叶变换红外吸收光谱仪、红外热成像仪、X射线荧光光谱仪、共焦显微拉曼光谱仪、PCR扩增仪、高低温交变湿热试验箱、人工气候箱、核酸电泳及成像系统等。
据介绍，实验室的启用既代表着国家古代壁画与土遗址保护工程技术研究中心东南分中心进入实体化运作，也为良渚潮湿环境土遗址保护进一步整合各个科研院校的专业资源开辟了新渠道。接下来，在学术委员会的指导下，良渚将依托东南分中心、联合实验室、监测保护研究基地等重要平台，积极开展潮湿环境土遗址保护基础理论深化研究、关键共性技术攻关、专有装备研制升级和科技成果转化应用等方面工作，为土遗址保护和利用作出积极贡献。
